Apache Flink 项目本身并不直接涉及 IntelliJ IDEA 的自动索引设置。IntelliJ IDEA 是一个流行的 Java 集成开发环境（IDE），它提供了丰富的功能，包括自动索引和代码导航。当你打开一个新的 GitHub 项目（无论是 Flink 还是其他项目）时，IDEA 通常会自动开始索引项目文件，以便提供代码补全、导航和其他功能。
但是，如果你发现 IDEA 没有自动索引你的 Flink 项目，或者索引过程出现问题，你可以尝试以下步骤来手动触发索引或解决索引问题：
1. 重新导入项目：
- 关闭当前项目。
- 选择 `File` > `Open`，然后重新选择你的 Flink 项目目录。
- 按照向导重新导入项目。
2. 手动触发索引：
- 在 IDEA 的底部状态栏，你应该能看到一个“Indexing”的进度条。如果没有，你可以尝试点击 `File` > `Invalidate Caches / Restart...` 来清除缓存并重启 IDEA。这通常会触发重新索引。
3. 检查项目设置：
- 确保项目的 SDK 和依赖项已正确设置。在 `File` > `Project Structure` 中检查这些设置。
- 确保 Maven 或 Gradle 插件（取决于你使用的构建工具）已正确配置，并能成功解析依赖。
4. 优化索引性能：
- 在 `File` > `Settings`（或 `Preferences` 在 macOS 上）中，搜索“Indexing”来查看和调整索引设置。
- 你可以尝试禁用某些不必要的索引选项，或者调整索引的线程数来优化性能。
5. 检查 IDEA 版本和插件：
- 确保你使用的是最新版本的 IntelliJ IDEA，并且所有相关插件都已更新到最新版本。
6. 查看 IDEA 日志：
- 如果上述步骤都没有解决问题，你可以查看 IDEA 的日志文件，以获取更多关于索引问题的信息。日志文件通常位于 `<用户目录>/.IntelliJIdea<版本>/system/log` 目录下。
7. 联系 IntelliJ 支持：
- 如果问题仍然存在，你可以考虑联系 IntelliJ IDEA 的官方支持或查看其官方文档和社区论坛，以获取更具体的帮助。
请注意，这些步骤是通用的 IntelliJ IDEA 使用建议，并不特定于 Apache Flink 项目。但是，它们应该能帮助你解决在 IDEA 中打开和索引 Flink 项目时遇到的问题。